いないち日記

大阪でバイオインフォマティクスを勉強する大学生の日記。

2017/10/17

朝7時に起きた。今日も朝から研究室。

昨日のバッティングセンターは結構な数打ったので筋肉痛が来るはずだが来ない。これは昨日摂取エネルギーが少なかったからか。明日にまとめて痛みが来そう。

朝は一昨日始めた計算の結果を確認するが、まだ終わっていない。しかたなく今日の進捗報告のスライドをなんとか作った。途中で%先生が来られて、ミーティング開始。

ミーティングでは主に中間発表のスライドを見てもらった。前回アドバイスしてもらった点を改善したつもりだったが、まだ大分と修正点が残る。学会なんかで発表するスライドはできるだけスライドに情報を載せるべき (口述で済ませる部分は細かい部分だけ) と言われ、スライドのみやすさを維持しつつ枚数を抑えつつうまく情報を入れるのにはどうすればいいかということで悩んだ。あと、言いたいことをスライドに載せる風の日本語でまとめるのが難しい。

昼からはいただいたフィードバックをもとにスライドを修正。途中で、過去に読んだプレゼン術の本の Reading note を読み返していると、結構今回の発表で活かせる TIPS があったので、それと今日頂いたアドバイスを元にもっとちゃんと作り込もうと思う。

夕方過ぎに帰って、いまは阪神vs DeNA を見ながら日記を書いている。昨日は画面の見すぎて夜は気分が悪かったので、今日はそろそろ液晶画面から離れることにする。

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2017/10/16

朝7時に起きた。今日も朝から研究室。

朝一番に昨日預けていた計算が終わっているか確認したが終わっていなかった。サンプル数が前回は700程度だったのに対し今回は10000ぐらいあるのが原因か。明日の進捗報告に間に合わないかもしれないが、まぁ明日はそれより中間発表のスライドをみてもらうのがメインなのでいいかという感じ。ただこの先もこの計算時間だと流石にマズいので、何らかの手は打ちたい。

昼前に%先生と話して、クラスタリングの際の距離尺度をどうするかという問題になった。今回はベクトル量より分布を比較したいので (たまたま分布をベクトル量でも表せるんだけど)、そうなると KL divergnce なんかが真っ先に思いつくが、それだと左右非対称になってしまうという問題がある。が、そもそも今回のクラスタリングの問題は本質的に距離が非対称ではないか、という話にもなったりした。とりあえず既存研究を洗い出してみることに。

昼からは既存研究の洗い出し。ただし ACL Anthology で見てみてもあまりそのたぐいの研究がヒットしなかった。

夕方は%が Keras のエラーで手こずっていたので、デバッグを手伝う。今日はバドミントンに行くはずだったが、どうもきりがいいタイミングを見失って、結局バドミントンはやめて3時間ぐらいデバッグに付き合っていた。が、まだ最後までプログラムは通せず。自分の研究ではないが、CNN の Keras の実装の感じを知れたので自分にとっても良い収穫になった。

夜はランニングをして、バッティングセンターに行った。

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2017/10/15

朝8時に起きた。今日は朝から大阪に帰る。

いつもの時間に古本屋に行き、電車で読むあたしンちを買ってから電車に乗った。駅からはバスで大学に行って、研究室でしばらく作業をした。

研究室では、GEO から取ってきたいくつかの発現プロファイルを自分のライブラリに通すためのデータ整形をした。研究室の他のメンバーがプログラムの引き継ぎでコードの意味を読み取るのに苦労している様子が伺えたので、これから Python プログラムは極力 Jupyter で作り、適宜 Markdown で見出しをつけながら見やすくしていこうと思った。

データの整形は今日で終わったので、あとは計算サーバーに計算を任せて研究室を後にした。

夜は大河ドラマの前に夕食を済ませて、お酒 (チューハイ 350ml) を飲んだ。大河ドラマの前にどうしてももう少しお酒が欲しくなったので、ビール 350ml をコンビニで買ってそれも飲んだ。

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2017/10/14

朝6時に起きた。今日は朝から塾バイト。

今日のバイトは人が少なくかなり暇だった。暇つぶしに電卓の √ ボタンを押していると、ある数が何回 √ ボタンを押すと1になるかというのにある規則性があることに気付いた。自分は遊びから科学的な何かを発見する体験がこれまであまりなかったので、こういう気付きをしたことに我ながら驚いた。

帰宅後は食欲が戻ってきたのでご飯をたくさん食べた。ご飯をたくさん食べるたら眠くなったので寝た。で、中途半端な時間に起きてしまったのでこうして日記を書いている。

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2017/10/13

朝7時に起きた。

午前中は眠く、布団の上で漫画を読んだりしていた。

昼からは塾バイト。今日は生徒対応より電話対応が多かった。保護者さんからの連絡を要点を抑えて社員に伝えるのは難しい。こういう類の問題はこのバイト以外にも出てくると思うので、一度ちゃんと練習しよう。

帰宅後は投げ込み。

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2017/10/12

朝7時に起きた。今日は研究室に行ったあと大津へ帰る。ふろ・トイレやキッチン周りの掃除を済ませて、いつもより遅く家を出た。

午前中は今日もスライドづくり。大分とアイデアが固まってきて、スライドの質は高くなった。あとは10分でまとめられるようにしっかり練習をしないと。

あと、スライドを作りながら気づいたが、Single cell のクラスタリングに関する先行研究を全然調べていなかった。ということでいくつかそれに関する論文を印刷した。これは週末に読むことにする。

昼過ぎ、プレゼン資料が大方完成した。その後は久しぶりに自然言語処理100本ノック何問か解いてから、大津へ。

大津に着いてから、髪が伸びたので初めて駅前にある理容室に。理容室に行くのは小学生ぶり? ぐらい。

その後は、別の美容室でヘアカラー。今日は珍しく空いていた。

夜は、久しぶりに日本酒 300ml を飲んだ。湖小蔵 (ここくら) というお酒で、まさに自分の好みのお酒だった。調べてみると蔵元は前の家のすぐ近くだった。

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2017/10/11

朝6時に起きた。お腹の調子が良くない。朝食をほとんど食べずに、朝から研究室。

午前中は昨日に引き続きスライド作り。今年は発表時間が10分となったので、これまでよりもスライドを圧縮しなければいけない。ただ昨年の卒論発表で#先輩が Single cell と LDA の話でも10分で説明するのは大変だったという話を聞いていたので、これに UMI の話と PAM の話を追加して10分というのは正直かなりきつい。ただ聴衆が理解できないような発表をしたくはないので、細かい話に立ち入ることはやめて、概要だけでも解ってもらえるように努めたい。

昼からもスライド作り。

夕方、研究室を出て病院へ。

その後は$のバドミントン。ドライブは基礎打ちの前にいくらか1人で打ったので、いつもよりはちゃんとした基礎打ちができた。ただ、ドロップの時に相手の方(女性)に、もっと奥まで飛ばしてくださいと言われてしまった。
試合自体は、右手をちゃんと後ろまで引くことを意識したらショットの速さは良くなった。また、前より前衛でのいいプレーが多くなった。次はもっと積極的に前に出ていきたいのと、スマッシュをもっとドライブで返したい。

バドミントンのあとは%温泉に寄って帰った。

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