いないち日記

大阪でバイオインフォマティクスを勉強する大学生の日記。

2017/09/18

朝7時にアラームで起きた。昨日寝た時間が遅かったので少し寝不足。今日は蛍池の家で臨時ゴミを出すのと部屋の掃除がある。臨時ゴミの収集が 9:30 以降だと勝手に思っていたら 8:00 以降だったので、焦って用意して蛍池へ。蛍池について5分ぐらいして、あと1…

2017/09/17

朝6時に起きた。 今日は台風が来るらしいので、一日家にこもることにした。朝、風が強かったが雨は降っていなかったので、買い物に行く。お腹の調子も良くなったのでちゃんとした料理を作った。昼からは PAM の論文を読んでいたが、モデルの定式化の部分をち…

2017/09/16

朝6時に起きたが、二度寝をして布団から出たのは8時。またあの胃の不快感が襲ってきた。昨日晩ごはんを食べている時に嫌な痛みが出たのでもしかしてとは思ったけど... 最近朝方が特に冷えていたのでそれが災いしていたのかもしれない。ということで今日は一…

2017/09/15

朝6時に起きた。今日はご飯を炊いて、しっかりと朝ごはんを作った。まだキッチンテーブルが来ていないので食器のダンボールを片付けきれてはいないが、ちょくちょく日常生活を取り戻せてきたと思う。いつもの時間に大学へ。今日も研究室バイト。昨日作り始め…

2017/09/14

朝6時に起きた。今日も研究室バイト。朝から昨日に引き続き Mallet のコードリーディング。途中で休憩がてらラボ内を歩いていたら誰も使っていなさそうな Macmini があり、聞いてみたら誰も使っていないそうだったので使うことにした。昼からはこの Macmini …

2017/09/13

朝 5:30 に起きた。昨日は早寝だったのですっきり起きれた。今日も研究室バイト。いろいろ調べてみて、結局 Pachinko Allocation Model (PAM) はPAM の著者が関わっている Mallet しかなさそうだったので、言語は Java だけどこれを使うことにする。ドキュメ…

2017/09/12

朝6時に起きた。昨日は疲れていたのになかなか眠れなかったので、疲れが残っていた。 今日は研究室バイト。今日の内容は、もらった遺伝子発現データをトピックモデルを用いてとりあえず解析してみるというもの。R の LDA パッケージは文章中の単語の出現頻度…

2017/09/11

朝7時に起きた。昼特が使える時間帯までまだ時間があるのでコーヒーを飲んで勉強をした。が、家でコーヒーを作るといつも気分が悪くなる。缶コーヒーに比べてカフェインが多いのかもしれない。帰省する日のコーヒーはやめようと思った。昼前に大阪へ戻る。今…

2017/09/10

6時に起きた。相変わらずお腹が弱いので、今朝は昨日の肉で胃が弱っていた。今日も朝からバイト。バイトは暇ができるが、あの場所ではあまり勉強する気になれないので暇を持て余してしまう。せっかくのPCから強制的に離れる機会なので、これから読書の時間に…

2017/09/09

朝6時に起きた。朝からバイト。ちょうどいい電車の時間がなかったので車で行った。昼ごはんは久々に$のパンを食べた。夕方、バイトが終わって LINE を見ると久しぶりに&から連絡が来て、今日の夜ご飯を食べることになった。@の車で南草津の焼肉屋へ。&は留年…

2017/09/08

朝 5:30 ごろ起床。昨日いくら疲れても起きる時間は変わらないようで、やや寝不足感がある。今日は1日予定は何も入れていない。 朝は前に読んだトピックモデルのサーベイの続きを読み切って、その内容を Evernote で整理した。昼はだらだら散歩したりして、…

2017/09/07

6時に起きた。今日は引越し当日。朝から最終的な荷造りをした。父が来てくれて車に荷物を積める。ついで引越し屋さんも来て、大きい荷物を運んでもらう。引越し屋さんのトラックと一緒に山田の家へ。その後はまだ運びきれない荷物があったので。もう一往復す…

2017/09/06

朝8時に起きた。午前中は荷造りと掃除。昼前に頼んでいたリサイクルショップの買い取りが来た。組立家具は値段がつかないそうで、キッチンテーブルの1000円だけもらった。そこから少し昼寝して、タイムズのカーシェア (6時間パック) を使って買い物へ。箕面…

2017/09/05

6時に起きた。調理道具や食器はほとんどダンボールに詰めたので、今日から数日はスーパーの惣菜やコンビニ弁当で済ます。今日はその1日目。コンビニのパンを食べて、吹田へ。自転車で行く。今日は涼しかったので楽に行けた。体育館が開く前に大学についたの…

2017/09/04

朝、少しトピックモデルの勉強をしてから大阪へ帰った。梅田に寄るのはこれ以降当分無いかもしれない。蛍池駅を使うのはもっと当分ないかもしれない。蛍池駅から家まで歩いて帰る道は... などと考えながら歩いていた。蛍池の家についてからは、ダンボール集…

2017/09/03

朝5:30に起きた。今日は市民大会。8時頃体育館についた。$先輩と合流して基礎打ち。そのあとチームの他の人たちと合流。%先輩と相談した結果、%先輩と自分とは交代で試合に出ることにした。最初に主審をした後、第1試合。相手をロースコアに抑えて勝つことが…

2017/09/02

朝7時に起きた。昨日より胃はましになったがまだ本調子ではない。午前中は R の TIPS を書いた。ようやく一通りまとめられた。昼前、昨日の掃除で不要となった衣類と本をそれぞれ古着屋と古本屋に売りに行った。2つ合わせて総額150円ほど。引き取ってもらえ…

2017/09/01

朝6時に起きた。胃の調子が最悪。胃の働きが弱い時にお酒とキムチのコンボ (昨日の夕食) は最悪だったらしい (胃に刺激を与えて活性化する目的があったんだけど、どうやら胃は弱っていたから動かなかったらしくこれは逆効果だった...) ということで、明日は…

2017/08/31

4:30 に起きた。今日も朝から研究室のバイト。そのまま大津に帰るのでモノレールで吹田へ。今日のメインタスクは LDAP (サーバー自体にLDAPを引くのと、dokuwiki の LDAPプラグインを動作させること)。 まずサーバーに LDAP を引こうとしたが、詳細な設定 (…

2017/08/30

朝6時に起きた。今日は自転車で大学へ。#に教えてもらったショートカットコース (鳥居があるところで171号線を抜ける) を使うと予想以上に楽に行けた。大学に着いたときはまだ体育館が開くまで少し時間があったので、投げ込みをした。 その後は体育館でシャ…

2017/08/29

朝4:30に起きた。最初は自転車で行こうと思っていたが、いつも空気入れを貸してもらっている自転車屋さんの空気入れが壊れていて、タイヤの空気が抜けてしまった。まだ早朝 (6時) で自転車屋はどこもまだ空いていないので他で空気を入れることもできず、予定…

2017/08/28

6時に起きた。午前中は豊キャンの図書館でトピックモデルの勉強。今まで軽く見た程度だった変分ベイズの式の導出を自分でやったりした。昼前に終わらせて、ふと思い立ってニトリに行って家具をいくつか調べる。ちょうどよいサイズ(30L)で2ペアになっているゴ…

2017/08/27

6時に起きた。朝はコーヒーを飲んで、トピックモデルの勉強。10時から家庭教師。3ヶ月ぶりで生徒さんの勉強環境も大分と変わっていた。塾に入ったようで、塾ではどのように進めているか・どのようなカリキュラムなのかを聞き取りながら進めていく。生徒さん…

2017/08/26

7:00ごろに起きた。今日は誕生日で、朝から Facebook で何人かからお祝いのメッセージをいただいた。ただ誕生日だからといって特にすることはないので、Rの教科書で知ったことを RMarkdown で書いたりしていた。RMarkdownを RStudio で書いて knitr で html …

2017/08/25

朝5時にアラームで起きた。かなり眠く、朝ごはんを食べたあとすこしだけ仮眠。今日も塾バイト。いつもの時間より少し早く家を出た。暑さからか、ちゃんと水分をとっているのに熱中症のような症状が出る。最近特に朝方は暑さに弱い。ネットで調べていると、低…

2017/08/24

5時にアラームで起きた。今日は塾バイト。夏休み終盤だからか生徒はいつもより多く、自由時間は少なかった。質問に来る生徒も多く充実はしていた。今日は"さんという方と一緒に入った。老後どう過ごすか、という話を少しした。夕方に帰宅。今日は久しぶりに…

2017/08/23

6時に起きた。今日は一日予定がないのでダラダラと過ごす。朝はトピックモデルの勉強やRの勉強。昼食に袋ラーメンを食べて、昼からは漫画を読んだり少し勉強をしたりしていた。夕方、リビングが使えないということでゴルフの打ちっぱなしへ。大分と空いてい…

2017/08/22

4:30にアラームで起きた。今日は眠気もなくすっきりと起きれた。準備をして吹田へ。研究室ではまず夏休みバイト (研究室内 Wiki の作成とSingle Cell のクラスタリング) のミーティングが予定されていたので、その下調べをする。その後しばらくソファーで寝…

2017/08/21

4:30にアラームで目が覚めた。研究室に行こうか迷ったが、電車で行ってもお金がかかるし自転車で行くと暑いしとで、結局今日は豊中で勉強することにする。図書館は9時からなので、時間に余裕もあることだし二度寝。9時から図書館へ。3Fのエアコンのそばは涼…

2017/08/20

朝は二度寝して、起きたのは6:30。朝食を食べてPCをずっと触っていたら気分が悪くなった。今日は不動産屋へ書類を書きに行く。自転車で千里中央へ。桃山台を経由するルートで行ったので中環沿いのルートよりも坂は緩やかだったが、それでもやっぱりきつかっ…

2017/08/19

今日も2:30に起きた。昨日と同じように家事をして昨日と同じように朝食をとると昨日と同じように眠たくなった。ただ二度寝は昨日より1時間短かった。朝から自転車で吹田キャンパスへ。途中で昨日決めた物件に寄る。大学についてからはシャワーを浴び、研究室…

2017/08/18

朝は2:30に目が覚めた。眠気は全然なかったので二度寝せず起きることにした。といってもあまりにも早すぎて始発もないので書き溜めていた日記を書いたりしていた。そのあと朝食を食べてゆっくりしていると眠気が出てきたので寝る。二度寝から起きたら8:30に…

2017/08/17

朝6時に目がさめたが二度寝。結局8時半に起きた。あまり食欲がなかったので食事は軽めにすませて、大学へ。もう定期が切れているので自転車で吹田へ。今日は小野原で左折するルート。大学についてからは体育館でシャワーを浴び、研究室へ。$さんと%さんは明…

2017/08/16

朝は少しトピックモデルの勉強をして、昼前に大阪に帰る。昨日もお酒を飲んでしまったためか胃・食道の調子が良くない。夕方からは大学のいつものメンバーで飲み会をした (名目としては自分のお疲れ様会も兼ねてもらっている)。楽しかった。帰りは%の家によ…

2017/08/15

5時にアラームで起きたが、眠かったため布団から出たのは6時。今日は朝から塾バイト。電車が20分待ちだったので、今日の昼食はいつものパン屋ではなくコンビニのおにぎりにすることにして、コンビニに寄る。塾は夏休みなので生徒は多いが、数年前よりは少な…

2017/08/14

朝から家庭教師の予定だったが、生徒が体調不良のため休み。久しぶりに1日暇な日ができた。午前中は甲子園を見たりグラフィカルモデルの勉強をしたりする。PRMLのページがなかなか進まない。昼まえに髪を切りに膳所の$へ行く。大津パルコが今月末で閉店とい…

2017/08/13

5時に起きた。昨日なかなか眠れなかったせいで眠く、結局布団から出たのは6時くらい。今日は塾バイト。いつもより30分早く来るように頼まれていたが、ちょうどその時間帯に湖西線がない。結局母に$駅まで送ってもらった。今日は高3生が模試なので校舎に来る…

2017/08/12

朝は6時に起きた。午前中は昨日読んだ論文でわからなかった英単語をピックアップして、英単語ノートを作った。このノートは大学受験時代にやっていたノートで、作っていると懐かしい感じがした。昼からは石高のOB会。今日は16人ほど。激しいスポーツをしてい…

2017/08/11

朝6時に起きた。散歩をして軽く朝食を食べたあと、論文読み。今日は Model-based clustering and data transformations for gene expression data*1 という論文で、複数のモデル (具体的には複数の種類の共分散行列を持つガウス分布) からどれがそのデータを…

2017/08/10

朝5時に起きた。今日は2ヶ月ぶりに塾バイトがある。支度を済ませて余裕を持って家を出る。電車はまた夏の朝特有の動悸があって1本のれなかった。時間に余裕を持たしておいてよかった。職場に行く前に、いつもの店でパンを買った。バイトが久しぶりなのでこの…

2017/08/09

ビル・ゲイツの Think week というのの真似で一昨年くらいから毎月一日 Think Day というのを設けていて、今日が今月のその日に当たる。ただ毎回別に何か特別なことをするわけではないので、これは研究や仕事がメインになってから必要な習慣だと思った。とい…

2017/08/08

6時ごろ起きた。朝から家でトピックモデルの本を読んだり漫画を読んだりスマホを触ったりしていた。昼前、甲子園の開幕試合 (彦根東の試合) を観た。途中から相手のバッターが彦根東のピッチャーのストレートのタイミングに合ってきたので不安だったが、最終…

2017/08/07

今日は京大の試験日。朝5時に起きた。台風が来ていて電車が動くか分からなかったので、父に&まで送ってもらってローカル線で京都へ。集合の1時間前に京大につく。なかなか会場が開かず、教室が開いたのは試験開始20分前 (集合時間) ちょうどだった。午前の試…

2017/08/06

朝は5時に目が覚めたが、眠かったので布団から出たのは6時。起きてからは適当に朝食を食べて適当にはじパタの復習をして適当に京大の過去問を見ていた。京大の問題は阪大のと異なり解ける・解けないが問題を見てすぐわかるので、解けると思った問題は解く気…

2017/08/05

今日は朝いつもの時間に起きる。昨日夜に%駅まで母を送りに・妹を迎えにいって寝る時間が遅かったので、朝は結構眠たかった。朝ははじパタの復習。特異値分解・部分空間法 (CLAFICとか)・誤差逆伝播法・アンサンブル学習など。線形変換して分散を最大にする…

2017/08/04

実家にいるが、生活リズムを崩さないためにいつもの時間に起きる。ただ実家なので朝にやる家事は特になく、起きた後はしばらく散歩をしていた。その後は軽めの食事をとって、はじパタ。今日はパーセプトロンの収束定理まで。昼まえ、京大の受験票を大阪に忘…

2017/08/03

いつもの時間にアラームで起きた。家事をぱぱっと済ませて、帰省の荷物とともに吹田へ。昨日の夜に買った自然言語処理の基本と技術という本を電車で読んでいたが、これがなかなかおもしろく、またNLPの様々な分野を数式抜きで知れるので勉強になる。研究室に…

2017/08/02

昨日書くのを忘れたので翌日 (8/3) に書いている。今日は授業があるので豊中へ。基礎工の自習室ではじパタの復習。今日はNN法の誤り率の上限がベイズ誤り率の2倍で抑えられる、という話など。その後は2限の教室へ。ちょうど掃除のおばちゃんが入ってきてしば…

2017/08/01

朝はアラームで早く起きた。家事をして吹田へ。午前中は昨日に引き続きはじパタ。今日はパラメトリック検定についてで、いろいろな最尤推定をしたりする。途中でお腹がすいたので菓子パンを食べる。とちょうど%さんが来たので少し話をする。昼食後は$と%が研…

2017/07/31

いつもより遅めに起きた。家事をしっかりめにしたあと、朝食を食べて大学へ。ラッシュ時と重なって電車が人混みだったので、朝は豊中で勉強して昼から吹田へ向かう。午前中はパターン認識の復習。はじパタ本を久しぶりに最初から見返した。最初は読むのに時…